En un artículo recientemente publicado en la revista especializada Genome Announcements, ADL Diagnostic Chile dio a conocer la secuencia del genoma de Yersinia ruckeri O1b (aislado 37551), agente que causó brote en peces que habían sido vacunados contra la enfermedad denominada Yersiniosis o Enfermedad de la Boca Roja (Enteric Redmouth Disease, ERM).
La secuencia se obtuvo a partir de aislados de campo de Y. ruckeri serotipo O1b, recuperado desde peces moribundos de la especie salmón Atlántico (Salmo salar), con un secuenciador de ADN de última generación. El análisis y anotación de los genes se realizó mediante la plataforma bioinformática que el laboratorio ADL posee para estos fines, “la cual es capaz de llevar a cabo la anotación automática de un genoma bacteriano en cuestión de horas”, aclaró Harry Bohle, jefe de Laboratorio y Master en Bioinformática. La secuencia anotada es de dominio público y se encuentra depositada en la base de datos de GenBank (número de acceso JPFO00000000) para que cualquier miembro de la comunidad científica y de la industria acuícola y farmacéutica pueda utilizarla.
La publicación entrega antecedentes que evidencian que los aislados de Y. ruckeri O1b son diferentes en su constitución genética respecto de las cepas utilizadas para la fabricación de vacunas, presentando genes de virulencia adicionales. Este hallazgo podría estar relacionado con una protección reducida de las vacunas comerciales a la fecha utilizadas con éxito para el control de la enfermedad. Sin embargo, frente a este nuevo antecedente, se requerirá probablemente una actualización de la formulación.
“La caracterización fenotípica de estas cepas se entregó en un reporte científico anterior (Bastardo et al., 2011), en el cual participaron activamente profesionales de nuestro equipo técnico. No obstante, la confirmación que apoya la tesis de la diferencia genética está dada por la secuenciación del genoma de la bacteria que estamos dando a conocer”, puntualizó Marcos Mancilla, PhD, director científico de la empresa. El conocimiento así generado ha permitido desarrollar un ensayo molecular (RT-PCR) que permite diferenciar estas nuevas cepas de aquellas tradicionales.
“Este trabajo aporta conocimiento y soluciones concretas a nuestros clientes y a la industria a través de la generación de herramientas de gestión y control en salud, y esconsecuente con nuestra política de desarrollo, investigación e innovación que hemos impulsado en ADL Diagnostic Chile desde hace algunos años”, concluyó el gerente general de la entidad privada, Patricio Bustos.
El texto completo de la publicación está disponible para descarga en http://genomea.asm.org/content/2/4/e00858-14