El investigador principal de la línea “Salud Animal en Ambiente Marino” del Centro Incar, Dr. Jaime Figueroa, presentó en el 10° Congreso de la Federación Europea de Microbiología, FEMS 2023, en Hamburgo, Alemania, los resultados del estudio “Bioinformatic analysis of Genomic Islands in whole genomes of Piscirickettsia salmonis strains”.
El trabajo que tiene por autores a Genaro Soto-Rauch, Guillermo Nourdin-Galindo, Denise Haussmann y al propio Dr. Figueroa, muestra el análisis bioinformático de genomas completos de Piscirickettsia salmonis (P. salmonis) seleccionadas por ser aisladas del sur de Chile y posteriores a la fecha de aislamiento de la cepa original LF-89, como cepa original.
Durante el estudio, se determinó que el genogrupo EM presenta islas similares entre sus genomas, en mayor proporción que los genomas del genogrupo LF, que muestran mayor variabilidad. “Entre las islas observadas se detectó un bajo número de factores virulentos, sin embargo, estos factores parecen acumularse en regiones adyacentes, dejando a las islas como puertas de entrada del proceso de reordenamiento génico y patogénico”, explicó el académico de la UACh e investigador principal de Incar, Dr. Jaime Figueroa.
Sobre los factores metabólicos, de resistencia y de simbiosis, a pesar de presentar identidades bajas, los propios genes conservan los mismos nombres, reafirmando el tipo de factor no virulento en islas genómicas.
De acuerdo con los investigadores, “estudios posteriores permitirán considerar la intervención de estas islas y el impacto en la patogenicidad, además de validar las islas de resistencia, metabólicas y de simbiosis”.
Los análisis se realizaron con varias herramientas bioinformáticas para la confirmación de islas genómicas candidatas lo que permitió la predicción y análisis de islas genómicas, incorporando características metabólicas, de resistencia y simbióticas.
El evento es organizado por la Federación Europea de Microbiología en conjunto con la Asociación de Microbiología General y Aplicada, y la Sociedad Alemana de Higiene y Microbiología.
Fotografía: Centro Incar