El Programa de Diversificación de la Acuicultura Chilena (PDACh) ha propuesto incorporar la genómica como herramienta tecnológica para el desarrollo inicial de cultivos y para la ejecución de programas de mejoramiento reproductivo de la especie Seriola lalandi, más conocida en el norte de Chile como dorado o palometa y/o yellowtail kingfish o hiramasa en los mercados internacionales.
Dentro de ese contexto, la empresa Acuícola del Norte S.A. (Acuinor) ha utilizado secuenciamiento a gran escala del transcriptoma del dorado, es decir de moléculas que son el producto de la expresión de genes de importancia funcional, considerando la implementación de estas tecnologías de secuenciamiento masivo dentro de la Unidad de Investigaciones en Biotecnologia y Genómica Animal de la Facultad de Ciencias Veterinarias y Pecuarias (Favet-Inbiogen) de la Universidad de Chile, liderado por el Dr. Víctor Martínez. Esta información, de acuerdo con lo afirmado por Acuinor, permitirá conocer los factores genéticos que influencian esta importante etapa de vida de este recurso y donde se generan la mayor cantidad de pérdidas a nivel productivo.
«Hemos podido caracterizar el transcriptoma de larvas durante el desarrollo temprano de Seriola lalandi, con el objetivo de obtener SNPs que sean caracterizados para esta especie, conocer los genes que explican la aparición de deformidades, uno de los más importantes problemas de la larvicultura de especies marinas», explicó a AQUA el gerente general de Acuinor, Daniel Elton, añadiendo que dentro de los resultados más relevantes se encuentran la disrupción de genes asociados con la formación del hueso y genes relacionados con la producción de colágeno.
Producto de esta misma investigación, la empresa ha podido detectar mas de 100.000 marcadores del tipo SNP (variación de una base nucleotídica) que están siendo estudiados para verificar su importancia en términos de cambios a nivel proteico. De esta forma será posible conocer el efecto sobre diversos fenotipos importantes para la producción del dorado.
«Esos marcadores, en conjunto con marcadores obtenidos a través de secuenciamiento del genoma completo de esta especie, nos permitirán en el corto plazo contar con una plataforma de genotipado affymetrix que permita considerar problemas asociados con la producción masiva en jaulas o en cultivo cerrado. Las enfermedades parasitarias y bacterianas serán una prioridad dentro del objetivo de mejoramiento de esta especie», subrayó Elton.
Proyecto Fondef
Los resultados alcanzados están siendo estudiados a fondo para entender el efecto de ciertos nutrientes sobre la disrupción en la expresión de estos genes bajo el proyecto Fondef «Mejoramiento del estatus nutricional en larvas de Seriola lalandi utilizando nuevos enriquecedores para alimentos vivos y microdietas inertes. Efecto de ácidos grasos esenciales sobre indicadores productivos y nivel de deformidades craneales y de columna», liderado por la Universidad Católica de Temuco, a través del profesor Patricio Dantagnan, y también por el Favet-Inbiogen, de la Universidad de Chile, con el Dr. Víctor Martínez a la cabeza.
«El uso de herramientas genómicas para la solución de problemas genéticos relacionados con estas nuevas especies acuícolas requiere de un alto grado de colaboración multidisciplinaria, por este motivo, hemos desarrollado vínculos directos con investigadores de renombre nacional e internacional, tanto de Estados Unidos y Chile en el área bioinformática, desarrollo genómico y en aspectos de nutrición. Todo esto para el desarrollo integral de programas de mejoramiento dentro del PDACh», concluyó el gerente general de Acuinor, Daniel Elton.
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