La coinfección es una infección de más de un patógeno. Y en un entorno acuático, la aparición más común es la del virus de la Necrosis Pancreática Infecciosa (IPNv, por su sigla en inglés) en presencia de otros virus como el de la Necrosis Hematopoyética Infecciosa (IHNv), el de la Septicemia Hemorrágica Viral (VHSv) y la Anemia Infecciosa del Salmón (ISAv) o alfavirus de salmónidos (SAv).
En la mayoría de los casos, el IPNv reduce la proliferación de otros virus en cultivos celulares o en los órganos internos de los salmónidos; por ejemplo, en coinfecciones por IHNv o ISAv. Sin embargo, también ocurre que no hay un efecto significativo en la multiplicación del virus con el que coexiste, como puede ser IPNv-VHSv.
Así se desprende de un artículo científico elaborado por Joanna Maj-Paluch y M. Reichert del Instituto Nacional de Veterinaria de Polonia y que fue publicado en el journal Medycyna Weterynaryjna (Medicina Veterinaria), en donde se subraya que «los mecanismos de defensa del cuerpo, el interferón y otros factores similares al interferón o las mutaciones en el genoma juegan un papel importante en la coinfección».